Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccpg1Q640L3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccpg1Q640L3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccpg1Q640L3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms