Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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Lcn4Q62472 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lcn4Q62472 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Lcn4Q62472 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Lcn4Q62472 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lcn4Q62472 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Lcn4Q62472 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Lcn4Q62472 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lcn4Q62472 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lcn4Q62472 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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