Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tff3Q62395 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tff3Q62395 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms