Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Scn9aQ62205 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Scn9aQ62205 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Scn9aQ62205 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Scn9aQ62205 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms