Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim27Q62158 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim27Q62158 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
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Trim27Q62158 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim27Q62158 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim27Q62158 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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