Protein–RNA interactions for Protein: Q61990

Pcbp2, Poly(rC)-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp2Q61990 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pcbp2Q61990 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pcbp2Q61990 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pcbp2Q61990 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms