Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pde3bQ61409 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pde3bQ61409 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pde3bQ61409 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms