Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcanQ61361 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcanQ61361 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BcanQ61361 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcanQ61361 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BcanQ61361 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BcanQ61361 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BcanQ61361 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcanQ61361 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BcanQ61361 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BcanQ61361 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BcanQ61361 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcanQ61361 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BcanQ61361 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcanQ61361 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BcanQ61361 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BcanQ61361 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BcanQ61361 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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