Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Foxd1Q61345 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Foxd1Q61345 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Foxd1Q61345 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Foxd1Q61345 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.1 ms