Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Ctnna2Q61301 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctnna2Q61301 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ctnna2Q61301 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms