Protein–RNA interactions for Protein: Q61239

Fnta, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntaQ61239 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FntaQ61239 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntaQ61239 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FntaQ61239 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FntaQ61239 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntaQ61239 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntaQ61239 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntaQ61239 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntaQ61239 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FntaQ61239 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntaQ61239 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntaQ61239 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms