Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lamb3Q61087 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lamb3Q61087 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lamb3Q61087 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms