Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc1Q61056 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trpc1Q61056 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trpc1Q61056 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms