Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Grik1Q60934 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grik1Q60934 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Grik1Q60934 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms