Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbpQ60925 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbpQ60925 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbpQ60925 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DbpQ60925 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DbpQ60925 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DbpQ60925 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DbpQ60925 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DbpQ60925 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms