Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnot7Q60809 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cnot7Q60809 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnot7Q60809 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnot7Q60809 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.9 ms