Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ItgaeQ60677 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ItgaeQ60677 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ItgaeQ60677 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms