Protein–RNA interactions for Protein: Q5YD48

A1cf, APOBEC1 complementation factor, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1cfQ5YD48 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A1cfQ5YD48 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A1cfQ5YD48 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A1cfQ5YD48 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms