Protein–RNA interactions for Protein: Q5U419

Mfsd3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd3Q5U419 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mfsd3Q5U419 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mfsd3Q5U419 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms