Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYD0

Myo1d, Unconventional myosin-Id, mousemouse

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1dQ5SYD0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Myo1dQ5SYD0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Myo1dQ5SYD0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Myo1dQ5SYD0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms