Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Specc1Q5SXY1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Specc1Q5SXY1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1Q5SXY1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms