Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ctc1Q5SUQ9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ctc1Q5SUQ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctc1Q5SUQ9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms