Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PkdccQ5RJI4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PkdccQ5RJI4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PkdccQ5RJI4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms