Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trav6-2Q5R1I4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trav6-2Q5R1I4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms