Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I3

Trav7-2, T cell receptor alpha variable 7-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav7-2Q5R1I3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trav7-2Q5R1I3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trav7-2Q5R1I3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms