Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Kdm6bQ5NCY0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Kdm6bQ5NCY0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Kdm6bQ5NCY0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Kdm6bQ5NCY0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms