Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SynaQ5G5D5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SynaQ5G5D5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SynaQ5G5D5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms