Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Usp13Q5BKP2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp13Q5BKP2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp13Q5BKP2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp13Q5BKP2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms