Protein–RNA interactions for Protein: Q56A06

Tmtc2, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc2Q56A06 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmtc2Q56A06 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmtc2Q56A06 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tmtc2Q56A06 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Tmtc2Q56A06 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms