Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Eme2Q56A04 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Eme2Q56A04 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Eme2Q56A04 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Eme2Q56A04 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms