Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc47Q505F5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc47Q505F5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc47Q505F5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms