Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Srek1ip1Q4V9W2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Srek1ip1Q4V9W2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Srek1ip1Q4V9W2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms