Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Khdc1cQ4KL78 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Khdc1cQ4KL78 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms