Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Syne3Q4FZC9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Syne3Q4FZC9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syne3Q4FZC9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms