Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga1Q3V3R4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga1Q3V3R4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Itga1Q3V3R4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms