Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc185Q3V118 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc185Q3V118 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc185Q3V118 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms