Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrfip1Q3UZ39 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrfip1Q3UZ39 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms