Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc160Q3UYG1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc160Q3UYG1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc160Q3UYG1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc160Q3UYG1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms