Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn13Q3UW68 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn13Q3UW68 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn13Q3UW68 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn13Q3UW68 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms