Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TceancQ3US16 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TceancQ3US16 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TceancQ3US16 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TceancQ3US16 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms