Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
D13Ertd608eQ3UPR8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
D13Ertd608eQ3UPR8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms