Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPP8

Cep63, Centrosomal protein of 63 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep63Q3UPP8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cep63Q3UPP8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cep63Q3UPP8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep63Q3UPP8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep63Q3UPP8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms