Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CrxosQ3UL53 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CrxosQ3UL53 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CrxosQ3UL53 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CrxosQ3UL53 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CrxosQ3UL53 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CrxosQ3UL53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms