Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atxn7l3bQ3UD01 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atxn7l3bQ3UD01 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn7l3bQ3UD01 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Atxn7l3bQ3UD01 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Atxn7l3bQ3UD01 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Atxn7l3bQ3UD01 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 182.9 ms