Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q3U595 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q3U595 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U595 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U595 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U595 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U595 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q3U595 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Q3U595 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q3U595 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q3U595 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q3U595 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U595 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U595 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U595 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U595 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U595 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q3U595 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q3U595 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q3U595 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Q3U595 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U595 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U595 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms