Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmd1Q3TXS7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmd1Q3TXS7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmd1Q3TXS7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms