Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pbxip1Q3TVI8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pbxip1Q3TVI8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pbxip1Q3TVI8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pbxip1Q3TVI8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms