Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Ccdc136Q3TVA9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Ccdc136Q3TVA9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Ccdc136Q3TVA9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ccdc136Q3TVA9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms