Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

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Length 876 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap5b1Q3TAP4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap5b1Q3TAP4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap5b1Q3TAP4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap5b1Q3TAP4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap5b1Q3TAP4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap5b1Q3TAP4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap5b1Q3TAP4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap5b1Q3TAP4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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