Protein–RNA interactions for Protein: Q2V6D6

Gbp8, Guanylate-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp8Q2V6D6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gbp8Q2V6D6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp8Q2V6D6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp8Q2V6D6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms